המוסלמים בירושלים מביעים חשש גדול מהשתלטות יהודית על אזורים בעיר העתיקה הסמוכים למתחם הר-הבית ומביעים חרדה לגורלו של מסגד אל-אקצה.

גורמים הקשורים לוואקף המוסלמי ומומחים פלסטינים לענייני ירושלים הזהירו מפני תכנית עתידית לבנייתו מחדש של בית הכנסת 'תפארת ישראל' בעיר העתיקה בירושלים והגדירו אותה אחת המסוכנות ביותר מאז מלחמת ששת הימים- כיוון שלטענתם מטרת בנית בית הכנסת היהודי מחדש הינה לבודד את אל-אקצה לקראת הריסתו בידי קיצונים.

דרשן מסגד אל-אקצה, מוחמד חוסיין, גינה את תחילת העבודות ב"שכונת אל-שרף" שנכבשה בעת ההשתלטות על העיר העתיקה ב-1967, לדבריו, " בית הכנסת נבנה על אדמת ווקף אסלאמי, במטרה לקבוע עובדות בשטח, להקיף את מסגד אל-אקצה בבתי כנסת ולמחות כל זכר אסלאמי וערבי בירושלים".

חוסיין הדגיש, כי העיר אל-קודס אסלאמית וערבית באופיה ו"הכיבוש" לא יצליח לשנות זאת.